Hasta ahora, hemos creído que el proyecto del Genoma Humano había sido concluido en varias ocasiones, pero en realidad, cada versión era una aproximación incompleta. Sin embargo, recientemente se ha dado a conocer un nuevo mapa genómico llamado «Pangenoma» que promete capturar toda la variación genética humana. Este avance científico, publicado en la revista Nature, combina el ADN completo de 47 individuos diversos, incluyendo africanos, nativos americanos y asiáticos, entre otros, con el objetivo de proporcionar una visión más amplia y precisa de la diversidad genética de nuestra especie.
El Pangenoma: Una Nueva Herramienta para Comprender la Diversidad Genética
El genoma humano es muy similar en la mayoría de las personas, pero son las pequeñas diferencias en cientos de miles de letras de ADN las que explican nuestra singularidad. El Pangenoma busca observar esta diversidad con mayor detalle que nunca antes, revelando puntos de cambio evolutivos y diferencias genéticas sorprendentemente grandes que no son observables en los estudios convencionales.
Para construir el Pangenoma, los investigadores utilizaron un concepto matemático llamado «gráfico». Este gráfico representa segmentos de ADN como puntos interconectados. Cada persona tiene un recorrido ligeramente diferente en su genoma, omitiendo algunos puntos y añadiendo otros. Esta aproximación permite visualizar las variaciones genéticas presentes en diferentes individuos y poblaciones.
Estos ensamblajes cubren más del 99% de la secuencia esperada en cada genoma y son más del 99% precisos a nivel estructural y de pares de bases. Basándose en alineaciones de los ensamblajes, se genera un borrador del pangenoma que captura variantes y haplotipos conocidos y revela nuevos alelos en loci estructuralmente complejos. Además, se añaden 119 millones de pares de bases de secuencias polimórficas eucromáticas y 1,115 duplicaciones génicas en comparación con la referencia existente GRCh38. Aproximadamente 90 millones de los pares de bases adicionales provienen de variación estructural. Utilizando este borrador del pangenoma para analizar datos de lecturas cortas, se redujeron los errores de descubrimiento de pequeñas variantes en un 34% y se aumentó el número de variantes estructurales detectadas por haplotipo en un 104% en comparación con los flujos de trabajo basados en GRCh38, lo que permitió tipificar la gran mayoría de los alelos de variantes estructurales por muestra.
Aplicaciones Potenciales del Pangenoma
Una de las aplicaciones potenciales más interesantes del Pangenoma es mejorar los métodos de diagnóstico de enfermedades raras. Al poder observar la diversidad genética en mayor detalle, incluyendo grandes diferencias como genes eliminados, invertidos o duplicados, se podrían identificar causas genéticas de enfermedades que hasta ahora no eran detectables con los métodos tradicionales.
Sin embargo, actualmente la mayoría de los biólogos y médicos continúan utilizando el «genoma de referencia» existente, el cual se basa en el ADN de un hombre afroamericano y otros segmentos de diversas personas. Esto puede generar un «sesgo de referencia», ya que se pueden perder información importante si el genoma de una persona no se ajusta a esta referencia.
El Pangenoma: Un Camino Hacia una Mayor Equidad Genética
El nuevo mapa genómico pretende abordar este sesgo de referencia y promover una investigación genética más equitativa. Cuanto más diferente sea el genoma de una persona en comparación con la referencia actual, mayor será la posibilidad de que se pierda información relevante. El Pangenoma tiene como objetivo ser más completo y diverso, incluyendo información genética de diferentes poblaciones y etnias, lo que permitirá una comprensión más precisa de la diversidad genética humana en su conjunto.
